[별표 2] 핵산염기 서열 또는 아미노산 서열목록 작성 세부기준

「핵산염기 서열 또는 아미노산 서열목록 작성 세부기준

1. 필수 기재사항

가. 서열목록에는 다음에서 정하는 사항을 필수적으로 기재하여야 한다.

1) 별표 3에서 규정하고 있는 다음 항목을 실제의 핵산염기 및 아미노산 서열의 바로 앞에 필수적으로 기재하여야 한다.

<110>	출원인 명칭의 영문표기
<120>	발명의 영문 명칭
<160>	서열식별번호의 수
<210>	서열식별번호
<211>	길이
<212>	타입
<213>	생물명
<400>	서열

2) 숫자식별기호 <110>의 출원인 명칭을 라틴 알파벳 이외의 문자로 표기하는 경우에는 발음대로 또는 영어로 번역하여 라틴 알파벳으로 기재하여야 한다.

3) 숫자식별기호 <110>, <120> 및 <160>의 경우를 제외한 기재사항들은 서열목록에 포함된 각 서열의 정보를 나타내기 위하여 반복적으로 기재하여야 한다.

4) 서열식별번호에 해당하는 서열이 없는 경우에는 <210> 및 <400>의 기재사항만을 필수적으로 기재하여야 한다.

나. 서열목록이 출원시 제출되거나 또는 출원번호를 부여받기 전에 제출된 경우, 서열목록에는 가목에서 규정한 기재사항에 다음의 기재사항을 추가하여 기재하여야 한다.

<130>	관리번호

다. 출원번호를 부여받은 후에 서열목록을 제출하거나 보정할 경우, 서열목록에는 가목에서 규정한 기재사항에 다음의 기재사항을 추가하여 기재하여야 한다.

<140>	출원번호
<141>	출원일자

라. 선출원에 대한 우선권을 주장하는 출원과 관련하여 서열목록을 제출하는 경우에는 가목에서 규정한 기재사항에 다음의 기재사항을 추가하여 기재하여야 한다.

<150>	우선권주장의 기초가 되는 출원의 출원번호
<151>	우선권주장의 기초가 되는 출원의 출원일자

마. 서열목록에 “n”, "Xaa”, 변형된 염기 또는 변형되거나 통상적으로 존재하지 않는 L-아미노산을 포함하는 경우에는 가목에서 규정한 기재사항에 다음의 기재사항을 추가하여 기재하여야 한다.

<220>	특징
<221>	명칭/기호(key)
<222>	위치
<223>	기타 정보

바. 숫자식별기호 <213>의 생물명이 “인공 서열”  또는 “불명”일 경우에는 가목에서 규정한 기재사항에 다음의 기재사항을 추가하여 기재하여야 한다.

<220>	특징
<223>	기타 정보

2. 임의 기재사항

별표 3에서 규정한 모든 기재사항들 중 제1호에서 언급되지 않은 기재사항들은 필요에 따라 선택적으로 기재할 수 있다.

3. 특징의 기재

가. 숫자식별기호<220>에 해당하는 서열의 특징은 별표 4 제5호 및 제6호에서 규정하는 서열에 관련된 특징기호로 기재하여야 한다.

나. 숫자식별기호<223>의 기타 정보에는 언어중립적 용어를 사용하지 않고 서열의 특성을 자유롭게 기재(이하 “자유텍스트”라 한다)할 수 있다.

다. 자유텍스트는 다음에서 정한 바에 따라 서열의 이해를 돕기 위하여 필수 불가결한 몇 개의 짧은 용어로 기재하여야 한다.

1) 영어로 기재할 경우에는 한 행에 최대 65자로 하여 4행을 초과하지 않도록 한다.

2) 추가의 정보들은 명세서의 해당 부분에서 해당 언어를 사용하여 기재한다.

라. 모든 자유텍스트는 영어로 기재할 것을 권장한다.

마. 명세서의 서열목록부분이 자유텍스트를 포함하는 경우에는 모든 자유텍스트를 명세서의 해당 부분에서 해당언어로 다시 기재하여야 한다. 이 경우, 명세서의 “서열목록 자유텍스트”라는 특정 항목에 기재할 것을 권장한다.

4. 서열목록의 기재 방법

가. 각 서열에 독립된 서열식별번호를 부여하여야 한다. 서열식별번호는 1 부터 시작하여 하나의 정수씩 증가한다.

나. 서열식별번호에 해당하는 서열이 존재하지 아니한 경우에는 서열식별번호 다음의 행에서 시작하는 숫자식별기호<400>에 코드 ㅇㅇㅇ으로 표시하여야 한다. 숫자식별기호 <160>에는 숫자식별기호<400>에 서열이 기재되었는지 또는 코드 ㅇㅇㅇ이 기재되었는지와 무관하게 서열식별번호의 전체 수를 기재하여야 한다.

다. 특허출원 등의 상세한 설명, 청구범위 또는 도면에서 서열목록에 나타낸 서열은 해당 서열식별번호를 “서열식별번호:X" 또는 ”SEQ ID NO : X"와 같이 기재하여야 한다.

라. 핵산염기 및 아미노산 서열은 다음의 세 가지 중 하나 이상으로 표시하여야 한다. 다만, 3)의 형식으로 개시된 서열의 경우 아미노산 서열은 독립된 서열식별번호를 가진 순수 아미노산 서열로서 서열목록에 독립적으로 기재하여야 한다.

1) 순수 핵산염기 서열

2) 순수 아미노산 서열

3) 핵산염기 서열과 이에 대응하는 아미노산 서열.

마. 서열목록에 기재하는 숫자식별기호의 순서는 별표 3에서 규정한 기재사항의 숫자식별기호 목록에 나열된 순서를 따라야 한다.

바. 서열목록에 기재되는 식별기호는 별표3에서 규정한 기재사항의 숫자식별기호만을 사용하여 기재하여야 하며, 해당 숫자식별기호에 대한 설명은 기재하지 않는다.

사. 서열목록에 기재할 필요가 있는 숫자식별기호만을 기재하며, 숫자식별기호 바로 뒤에 해당 정보를 기재하여야 한다. 다만, 서열의 “특징”과 “간행물 정보”를 나타내는 각각의 숫자식별기호 <220>과 <300>은 다음에서 정한 바에 따라 각각 숫자식별기호 <221> 부터 <223>까지, <301>부터 <312>까지의 정보와 연결된다.

1) 서열목록에서 서열의 특징과 간행물정보가 이러한 숫자식별기호로 제공될 때는 숫자식별기호 <220>이나 <300>을 각각 포함시켜야 하고 해당 정보 기재란은 공란으로 남겨둔다.

2) 숫자식별기호의 첫 번째나 두 번째 숫자가 바뀌면 숫자식별기호 사이에 공란의 한 행을 삽입하여야 한다. 다만, 숫자식별기호 <310> 앞에서만은 빈 행을 두지 않는다.

3) 숫자식별기호가 반복될 때에도 공란의 한 행을 삽입한다.

5. 핵산염기 서열의 기호 및 형식

가. 핵산염기 서열은 5'-말단에서 3'-말단 방향으로 왼쪽에서 오른쪽으로 하나의 본쇄로만 작성되어야 한다. 다만 3' 및 5'는 서열에 표시하지 아니한다.

나. 핵산염기 서열의 염기는 핵산염기 서열의 문자들에 대한 단일 문자 코드에 따라 별표 4 제1호의 핵산염기의 목록과 일치하는 소문자만을 사용하여 기재하여야 한다.

다. 변형된 염기가 별표 4 제2호의 변형 핵산염기 목록에 수록된 염기에 해당하는 경우에는 서열자체에 다음의 방법 중 하나를 선택하여 기재하며, 변형된 내용은 서열목록의 ‘특징’ 부분에 별표 4 제2호의 변형 핵산염기 목록에서 주어진 기호를 사용하여 상세히 기재하여야 한다. 다만, 상기 기호는 서열 자체에서 사용할 수 없다.

1) 변형된 염기에 대응하는 변형되지 않은 염기로 기재

2) 불명 또는 변형된 하나의 핵산염기에 해당하는 기호 “n”을 기재

라. 핵산염기 서열은 한 행당 최대 60개의 염기로 기재하며, 10개의 염기군마다 하나의 공란을 두어야 한다.

마. 서열의 코드영역을 제외한 핵산염기 서열의 염기(인트론 포함)는 10개의 염기군으로 기재하며, 말단에 잔여 염기수가 10개 미만인 경우 하나의 군으로 묶고 인접한 군으로부터 하나의 공란을 두어 구분하여야 한다.

바. 핵산염기 서열의 코드영역의 염기는 트리플랫(코돈)으로 기재하여야 한다.

사. 핵산염기의 번호는 서열의 첫 번째 염기를 1로 하며, 5’에서 3’방향으로 서열 전체에 걸쳐서 하나씩 증가하는 번호를 부여한다.

아. 핵산염기의 번호는 염기에 대한 1문자 코드로 기재된 행의 오른쪽 여백에 그 행의 마지막 염기번호를 기재하여야 한다.

자. 환상구조를 가진 염기서열은 출원인이 서열의 첫 번째 핵산염기를 임의로 지정할 수 있다.

차. 길이가 긴 서열의 서로 인접하지 않는 하나 이상의 단편(non-contiguos segment) 또는 서로 다른 서열로부터의 단편들로 이루어진 핵산염기 서열은 독립된 서열식별번호를 부여하여야 한다.

카. 갭(Gap)이 있는 서열은 독립된 서열식별기호를 지닌 복수개의 독립된 서열로 갈음하여 번호를 부여하여야 하며, 이 경우 독립된 서열의 수는 서열데이터의 연속적인 스트링(continuous string)의 수와 동일하다.

6. 아미노산 서열의 기호 및 형식

가. 단백질 또는 펩티드 서열의 아미노산은 아미노에서 카르복시 방향으로 왼쪽에서 오른쪽으로 기재하여야 한다. 다만, 아미노기 및 카르복시기는 서열에 표시하지 아니한다.

나. 아미노산은 별표 4 제3호의 아미노산 목록과 일치하는 3문자 기호로 기재하여야 하며, 첫문자는 대문자로 기재하여야 한다.

다. 공란이나 내부 종결 부호(internal terminator symbol)를 포함한 아미노산 서열(예: “Ter”, “*”, “.” 등)은 단일 아미노산 서열로 기재하지 아니하고, 독립된 아미노산 서열들로 기재하여야 한다.

라. 변형되고 통상적으로 존재하지 않는 아미노산이 별표 4 제4호의 변형 및 이상 아미노산 목록에 수록된 아미노산에 해당하는 경우 서열자체에 다음의 방법 중 하나를 선택하여 기재하고, 변형된 내용은 서열목록의 ‘특징’부분에 별표 4 제4호의 변형 및 이상 아미노산 목록에서 주어진 기호를 사용하여 상세히 기재하여야 한다. 다만, 상기 기호는 서열자체에서 사용할 수 없다.

1) 변형되고 통상적으로 존재하지 않는 아미노산에 대응하는 변형되지 않은 아미노산으로 기재

2) 불명 또는 변형된 하나의 아미노산에 해당하는 기호 "Xaa”로 기재

마. 단백질이나 펩티드 서열은 한 행당 최대 16개의 아미노산으로 기재하여야 하며 각 아미노산을 공란으로 구분하여야 한다.

바. 핵산염기 서열의 코드영역의 코돈에 대응하는 아미노산은 대응하는 코돈의 바로 아래에 기재하여야 한다. 다만, 코돈이 인트론에 의하여 나누어지는 경우에는 아미노산 기호를 두 핵산염기를 포함하는 코돈영역 바로 아래에 기재하여야 한다.

사. 아미노산 번호는 서열의 첫 번째 아미노산을 1로 하며, 프리서열(pre-sequence), 프로서열(pro-sequence), 프리프로서열(pre-pro-sequence), 시그널서열(signal sequence)과 같은 성숙단백질의 앞부분에 있는 아미노산들은 1번 아미노산의 바로 옆에 있는 아미노산에서부터 -1로 시작하여 N말단 방향으로 1씩 감소하는 음의 수를 부여한다.

아. 성숙 단백질을 구별하기 위해 음의 수를 사용하여 아미노산에 번호를 부여할 경우 숫자 영(0)은 사용하지 아니한다.

자. 아미노산 번호는 5개의 아미노산마다 기재하여야 한다.

차. 환상구조를 가진 아미노산 서열은 출원인이 서열의 첫 번째 아미노산을 임의로 지정할 수 있다.

카. 길이가 긴 서열의 서로 인접하지 않는 하나 이상의 단편(non-contiguos segment) 또는 서로 다른 서열로부터의 단편들로 이루어진 아미노산 서열은 독립된 서열식별번호를 부여하여야 한다.

타. 갭(Gap)이 있는 서열은 독립된 서열식별번호를 지닌 복수개의 독립적인 서열로 갈음하여 독립적으로 서열식별번호를 부여하여야 하며, 이 경우 독립된 서열의 수는 서열데이터 내의 연속적인 스트링의 수와 동일하다.

7. 서열목록전자파일의 작성기준

가. 서열목록전자파일은 제1호에서부터 제6호까지의 기준에 따라 특허청에서 제공하는 소프트웨어 또는 특허청 홈페이지를 이용하여 작성하여야 한다.

나. 서열목록전자파일은 IBM 코드페이지(Code Page) 437, IBM 코드 페이지(Code Page) 932 또는 이와 호환 가능한 코드페이지를 사용하여 인코딩한다. 일본어, 중국어, 아라비아어, 그리스어, 히브리어 글자용 호환 가능한 코드페이지는 로마자 알파벳과 숫자를 앞에서 언급한 코드페이지들과 동일한 헥사데시말 위치에 부여하는 것이다.

다. 압축된 파일이 특허청이 인정하는 PC운영시스템에서 압축을 풀 수 있는 형태라면 압축된 형태로 서열목록전자파일을 제출할 수 있다.

라. 서열목록전자파일을 전자적기록매체로 제출하는 경우에는 전자적기록매체에 쓰기방지(읽기전용, writeprotect) 설정을 하여야 하며, 서열목록전자파일이라는 제목, 출원인 성명(명칭), 발명의 명칭, 대리인 성명, 제출일, 구분(출원시 제출, 보정 제출인지의 여부)을 기재한 라벨을 부착하여야 한다.

8. 기 타

가. 이 기준은 WIPO 표준 ST.25를 반영한 것으로 이 기준에 따라 작성한 핵산염기 및 아미노산 서열목록은 국내 특허출원 등 뿐 아니라 국제출원시의 국제조사 및 예비심사기관, 지정국 및 선택국에서 각각 요구하는 서열목록 작성 요건을 충족시킬 수 있다.

나. 이 기준에 따라 서열목록을 작성하고자 하는 자는 별표 5의 서열목록 작성 사례를 참고할 수 있다.