[별표 4] 핵산염기 및 아미노산 기호 및 특징(Feature) 표

1. 핵산염기 목록
기 호	의 미					지정의 기원
a	a					아데닌(adenine)의 a
g	g					구아닌(guanine)의 g
c	c					시토신(cytosine)의 c
t	t					티민(thymine)의 t
u	u					우라실(uracil)의 u
r	g 또는 a					푸린(purine)의 r
y	t/u 또는 c					피리미딘(pyrimidine)의 y
m	a 또는 c					아미노(amino)의 m
k	g 또는 t/u					케토(keto)의 k
s	g 또는 c					강한 상호작용(strong interactions)의 s 3H-결합
w	a 또는 t/u					약한 상호작용(weak interactions)의 w 2H-결합
b	g 또는 c 또는 t/u					아데닌(a) 아님
d	a 또는 g 또는 t/u					시토신(c) 아님
h	a 또는 c 또는 t/u					구아닌(g) 아님
v	a 또는 g 또는 c					티민(t) 아님, 우라실(u) 아님
n	a 또는 g 또는 c 또는 t/u, 불명 또는 기타					임의(any)의 n
2. 변형(modified) 핵산염기 목록
기 호			의 미
ac4c			4-아세틸시티딘 (4-acetylcytidine)
chm5u			5-카르복시히드록시메틸)우리딘 (5-(carboxyhydroxymethyl)uridine)
cm			2'-O-메틸시티딘 (2'-O-methylcytidine)
cmnm5s2u			5-카르복시메틸아미노메틸-2-티오우리딘 (5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine)
cmnm5u			5-카르복시메틸아미노메틸우리딘 (5-carboxymethylaminomethyluridine)
d			디히드로우리딘 (dihydrouridine)
fm			2'-O-메틸슈도우리딘 (2'-O-methylpseudouridine)
gal q			β, D-갈락토실큐에오신 (beta, D-galactosylqueosine)
gm			2'-O-메틸구아노신 (2'-O-methylguanosine)
i			이노신 (inosine)
i6a			N6-이소펜테닐아데노신 (N6-isopentenyladenosine)
mla			1-메틸아데노신 (1-methyladenosine)
mlf			1-메틸슈도우리딘 (1-methylpseudouridine)
mlg			1-메틸구아노신 (1-methylguanosine)
mli			1-메틸이노신 (1-methylinosine)
m22g			2, 2-디메틸구아노신 (2, 2-dimethylguanosine)
m2a			2-메틸아데노신 (2-methyladenosine)
m2g			2-메틸구아노신 (2-methylguanosine)
m3c			3-메틸시티딘 (3-methylcytidine)
m5c			5-메틸시티딘 (5-methylcytidine)
m6a			N6-메틸아데노신 (N6-methyladenosine)
m7g			7-메틸구아노신 (7-methylguanosine)
mam5u			5-메틸아미노메틸우리딘 (5-methylaminomethyluridine)
mam5s2u			5-메톡시아미노메틸-2-티오우리딘 (5-methoxyaminomethyl-2-thiouridine)
man q			β, D-만노실큐에오신 (beta, D-mannosylqueosine)
mcm5s2u			5-메톡시카르보닐메틸-2-티오우리딘 (5-methoxycarbonylmethyl-2-thiouridine)
mcm5u			5-메톡시카르보닐메틸우리딘 (5-methoxycarbonylmethyluridine)
mo5u			5-메톡시우리딘 (5-methoxyuridine)
ms2i6a			2-메틸티오-N6-이소펜테닐아데노신 (2-methylthio-N6-isopentenyladenosine)
ms2t6a			N-(9-β-D-리보푸라노실-2-메틸티오푸린-6-일)카르바모일)트레오닌 (N-((9-beta-D-rivofuranosyl-2-methylthiopurine-6-yl)carbamoyl)threonine)
mt6a			N-((9-β-D-리보푸라노실푸린-6-일)N-메틸카르바모일)트레오닌 (N-((9-beta-D-ribofuranosylpurine-6-yl)N-methylcarbamoyl) threonine)
mv			우리딘-5-옥시아세트산-메틸에스테르 (uridine-5-oxyacetic acid-methylester
o5u			우리딘-5-옥시아세트산 (uridine-5-oxyacetic acid)
osyw			와이부톡소신 (wybutoxosine)
p			슈도우리딘 (pseudouridine)
q			큐에오신 (queosine)
s2c			2-티오시티딘 (2-thiocytidine)
s2t			5-메틸-2-티오우리딘 (5-methyl-2-thiouridine)
s2u			2-티오우리딘 (2-thiouridine)
s4u			4-티오우리딘 (4-thiouridine)
t			5-메틸우리딘 (5-methyluridine)
t6a			N-((9-β-D-리보푸라노실푸린-6-일)-카르바모일)트레오닌 (N-((9-beta-D-ribofuranosylpurine-6-yl)-carbamoyl) threonine
tm			2'-O-메틸-5-메틸우리딘 (2'-O-methyl-5-methyluridine)
um			2'-O-메틸우리딘 (2'-O-methyluridine)
yw			와이부토신 (wybutosine)
x			3-(3-아미노-3-카르복시-프로필)우리딘, (acp3)u (3-(3-amino-3-carboxy-propyl)uridine, (acp3)u
3. 아미노산 목록
기 호				의 미
Ala				알라닌 (Alanine)
Cys				시스테인 (Cysteine)
Asp				아스파르트산 (Aspartic Acid)
Glu				글루탐산 (Glutamic Acid)
Phe				페닐알라닌 (Phenylalanine)
Gly				글리신 (Glycine)
His				히스티딘 (Histidine)
Ile				이소류신 (Isoleucine)
Lys				리신 (Lysine)
Leu				류신 (Leucine)
Met				메티오닌 (Methionine)
Asn				아스파라긴 (Asparagine)
Pro				프롤린 (Proline)
Gln				글루타민 (Glutamine)
Arg				아르기닌 (Arginine)
Ser				세린 (Serine)
Thr				트레오닌 (Threonine)
Val				발린 (Valine)
Trp				트립토판 (Tryptophan)
Tyr				티로신 (Tyrosine)
Asx				Asp 또는 Asn
Glx				Glu 또는 Gln
Xaa				불명 또는 기타 아미노산
4. 변형(modified) 및 이상(unusual) 아미노산 목록
기 호		의 미
Aad		2-아미노아디프산 (2-Aminoadipic acid)
bAad		3-아미노아디프산 (3-Aminoadipic acid)
bAla		β-알라닌, β-아미노프로피온산 (beta-Alanine, beta-Aminopropionic acid)
Abu		2-아미노부티르산 (2-Aminobutyric aicd)
4Abu		4-아미노부티르산, 피페리딘산 (4-Aminobutyric acid, Piperidinic aicd)
Acp		6-아미노카프로산 (6-Aminocaproic acid)
Ahe		2-아미노헵타노산 (2-Aminoheptanoic acid)
Aib		2-아미노이소부티르산 (2-Aminoisobutyric acid)
bAib		3-아미노이소부티르산 (3-Aminoisobutyric aicd)
Apm		2-아미노피멜산 (2-Aminopimelic acid)
Dbu		2,4-디아미노부틸산 (2,4-Diaminobutyric acid)
Des		데스모신 (Desmosine)
Dpm		2,2'-디아미노피메린산 (2,2'-Diaminopimelic acid)
Dpr		2,3'-디아미노프로피온산 (2,3'-Diaminopropionic acid)
EtGly		N-에틸글리신 (N-Ethylglycine)
EtAsn		N-에틸아스파라긴 (N-Ethylasparagine)
Hyl		히드록시리신 (Hydroxylysine)
aHyl		알로-히드록시리신 (allo-Hydroxylysine)
3Hyp		3-히드록시프롤린 (3-Hydroxyproline)
4Hyp		4-히드록시프롤린 (4-Hydroxyproline)
Ide		이소데스모신 (Isodesmosine)
aIle		알로-이소류신 (allo-Isoleucine)
MeGly		N-메틸글리신, 사르코신 (N-Methylglycine, Sarcosine)
MeIle		N-메틸이소류신 (N-Methylisoleucine)
MeLys		6-N-메틸리신 (6-N-Methyllysine)
MeVal		N-메틸발린 (N-Methylvaline)
Nva		노르발린 (Norvaline)
Nle		노르류신 (Norleucine)
Orn		오르니틴 (Ornithine)
5. 핵산염기 서열에 관련된 특징 기호 목록
기 호					설 명
allele					동족의 개체 또는 계통에서 같은 유전자가 안정적이면서 서로 다른 형태를 가지는 것을 말함; 대립 유전자(allele)는 같은 위치에 존재하나 서로 다른 서열을 가짐
attenuator					1) 전사의 종료를 조절하는 부위로서 일부 박테리아 오페론의 발현을 조절하는 DNA 영역; 2) 프로모터와 첫 번째 구조 유전자 사이에 위치하는 서열 단편으로서 전사의 불완전한 종료를 야기함
C_region					면역글로불린 경쇄와 중쇄의 불변 영역 및 T-세포 수용체 알파쇄, 베타쇄와 감마쇄의 불변 영역; 쇄의 종류에 따라 하나 이상의 엑손을 포함
CAAT_signal					CAAT 박스; 진핵생물 전사단위의 개시점으로부터 약 75bp 상류에 위치하는 보존 서열의 일부로, RNA 중합효소 결합에 관여함; 컨센서스=GG(C또는T)CAATCT
CDS					코딩 서열; 특정 단백질의 아미노산 서열에 상응하는 핵산염기 서열(종료 코돈을 포함함); 이 기호는 아미노산으로 번역될 수 있는 부분을 포함
conflict					“동일” 서열이지만 특정 부위 또는 영역에서 차이가 있는 부분
D-loop					치환 루프(Displacement loop); 짧은 길이의 RNA가 DNA 한 가닥과 짝을 이루면서 원래의 짝 DNA 가닥을 치환시키는 미토콘드리아 DNA내 영역; 또한 RecA 단백질에 의해 촉매되는 반응에서 단일 가닥의 침입자에 의해 이중나선 DNA중 한 가닥이 치환되는 부위를 의미하기도 함
D-segment					면역글로불린 중쇄의 다양성(diversity) 단편 및 T-세포 수용체 베타쇄의 다양성 단편
enhancer					(일부)진핵생물의 프로모터의 사용을 증가시키는 시스-작동 서열; 프로모터를 중심으로 어느 방향으로도 그리고 어떠한 위치(상류 또는 하류)에서도 작용할 수 있음
exon					스플라이싱된 mRNA 부분을 코딩하는 게놈 영역; 5'UTR, 모든 CDS, 및 3'UTR을 포함할 수 있음
gene					유전자로 확인되어 생물학적 의의를 갖는 영역으로서 이에 대하여 별도의 명칭이 부여된 부분
GC_signal					GC 박스; 진핵생물 전사 단위의 개시점 상류에 위치하는 보존된 GC-풍부 영역으로 다중 카피로 존재하거나 어떠한 방향으로도 존재할 수 있음; 컨센서스=GGGCGG
iDNA					개재(intervening) DNA; 각종 재조합 과정을 통하여 제거되는 DNA
intron					전사는 되지만 스플라이싱을 통하여 이의 양옆 서열들(엑손들)이 이어맞추어짐으로써 전사체로부터 제거되는 DNA 단편
J_segment					면역글로불린 경쇄와 중쇄의 연결 단편(joining segment) 및 T-세포 수용체 알파쇄, 베타쇄, 그리고 감마쇄의 연결 단편
LTR					긴 말단 반복서열(long terminal repeat) ; 특정 서열의 양말단에 반복적으로 존재하는 서열로 일반적으로 레트로바이러스에서 발견됨
mat_peptide					성숙펩티드 또는 성숙단백질을 코드하는 서열; 번역후 변형 과정 후에 얻어지는 성숙 또는 최종펩티드 또는 성숙 또는 최종단백질 산물을 코드하는 서열 ; (CDS와는 달리)종료 코돈을 포함하지 않음
misc_binding					다른 결합 기호(primer_bind 또는 protein_bind)로는 표시할 수 없는 또 다른 잔기에 공유 또는 비공유 결합하는 핵산 부위
misc_difference					특징 서열이 입력 사항과는 다르고, 다른 특수 기호(conflict, unsure, old_sequence, mutation, variation, allele, 또는 modified_base)에 의하여 표시할 수 없는 경우
misc_feature					다른 특징 기호로 표시할 수 없는 생물학적 의의를 갖는 영역; 새로운 또는 희귀한 특징
misc_recomb					일반적, 부위-특이적 또는 복제적 재조합에 일어나는 부위로, 다른 재조합 기호(iDNA 및 virion) 또는 기원 기호(/insertion_seq, /transposon, /proviral)로는 표시할 수 없는 이중가닥 DNA의 절단 및 재결합이 일어나는 영역
misc_RNA					다른 RNA 기호들(prim_transcript, precursor_ RNA, mRNA, 5'clip, 3'clip, 5'UTR, 3'UTR, exon, CDS, sig_peptide, transit_peptide, mat_peptide, intron, polyA_site, rRNA, tRNA, scRNA, 및 snRNA)로는 정의될 수 없는 전사체 또는 RNA 산물
misc_signal					다른 신호 기호(promoter, CAAT_signal, TATA_signal, -35_signal, -10_signal, GC_signal, RBS, polyA_signal, enhancer, attenuator, terminator, 및 rep_origin)로는 표시할 수 없는, 유전자의 기능 또는 발현을 조절 또는 변형시키는 신호를 포함하는 영역
misc_structure					다른 구조 기호(stem_loop 및 D-loop)로는 표시할 수 없는, 2차 또는 3차구조 또는 입체구조(conformation)
modified_base					표시된 핵산염기는 변형된 핵산염기이고, 이는 표시된 분자(mod_base 한정치로 주어짐)로 치환되어야 함
mRNA					전령 RNA; 5'비번역 영역(5'UTR), 코딩 서열(CDS, exon) 및 3'비번역 영역(3'UTR)을 포함함
mutation					서열의 현위치 상에서 돌연적이고 유전적인 변화를 가짐
N_region					재배열된 면역글로불린 단편들 사이에 삽입되는 잉여의 핵산염기
old_sequence					제시된 서열은 이전 버전의 서열을 현 위치에서 교정한 것임
polyA_signal					RNA 전사체의 엔도뉴클레아제 절단에 필요한 인식 영역으로 폴리아데닐화가 되어 있음; 컨센서스=AATAAA
polyA_site					전사 후 폴리아데닐화에 의해 아데닌 잔기가 추가될 RNA 전사체 상의 부위
precursor_RNA					성숙 RNA 상태 이전의 RNA; 5'클립화된 영역(5'clip), 5'비번역 영역(5'UTR), 코딩 서열(CDS, exon), 개재 서열(intron), 3'비번역 영역(3'UTR), 및 3'클립화된 영역(3'clip)을 포함할 수 있음
prim_transcript					1차(초기, 프로세스되지 않은) 전사체; 5'클립화된 영역(5'clip), 5'-비번역 영역(5'UTR), 코딩 서열(CDS, exon), 개재 서열(intron), 3'비번역 영역(3'UTR), 및 3'클립화된 영역(3'clip)을 포함함
primer_bind					복제, 전사, 또는 역전사 개시를 위해 프라이머가 비공유적으로 결합하는 부위 ; 합성 PCR 프라이머 결합 부위를 포함함
promoter					RNA 중합효소 결합에 관여하여 전사를 개시하는 DNA 분자의 영역
protein_bind					핵산의 비-공유 단백질 결합 부위
RBS					리보좀 결합 부위
rep_origin					복제 개시점; 두 개의 동일한 카피를 만드는 핵산 복제를 위한 개시점
repeat_region					반복 단위를 포함하는 게놈 영역
repeat_unit					단일 반복 요소
rRNA					성숙 리보좀 RNA; 아미노산을 단백질로 조립하는 리보좀의 RNA 성분
S_region					면역글로불린 중쇄의 스위치 영역 ; 동일 B-세포로부터 다른 종류(class)의 면역글로불린을 발현시키기 위한 중쇄 DNA의 재배열 과정에 관여함
satellite					짧은 반복 단위로 된 다수의 일련 반복체(tandem repeats)(동일 또는 유사); 대부분은 일반적인 게놈과는 다른 염기 조성이나 그 외의 특성을 지니므로 벌크(주 밴드) 게놈 DNA와 구별됨
scRNA					작은(small) 세포질 RNA; 세포질 또는 (때때로)진핵생물의 핵에 존재하는 각종 작은 세포질 RNA 분자
sig_peptide					시그널 펩티드 코딩 서열; 분비되는 단백질의 N-말단 도메인의 코딩 서열; 이 도메인은 초기(nascent) 폴리펩티드를 막에 부착시키는 과정에 관여함; 리더 서열
snRNA					작은(small) 핵 RNA; 핵에만 존재하는 다수의 작은 RNA; snRNA 중 일부는 스플라이싱 또는 다른 RNA 프로세싱 반응에 관여함
source					특정 구간의 서열에 대한 생물학적 기원 ; 이 기호는 필수 기재사항임 ; 전체 서열에 대하여 최소한 하나의 기원 기호가 표시되어야 함 ; 서열 하나에 하나 이상의 기원 기호가 있는 것도 인정됨
stem_loop					헤어핀; 단일 가닥의 RNA 또는 DNA에서 인접한 (역위의) 상보적 서열이 염기 결합하여 형성된 이중-나선 영역
STS					서열 표지 자리(Sequence Tagged Site) ; 게놈상의 맵핑(mapping) 표식으로서, PCR에 의해 탐지될 수 있는 짧은 단일-카피 DNA 서열; STSs 시리즈의 순서를 탐지하여 게놈 영역을 맵핑할 수 있음
TATA_signal					TATA 박스; 골드버그-호그니스 박스; 진핵생물의 RNA 중합효소 II 전사 단위 개시점에서 약 25bp 앞에서 발견되는 보존된 AT-풍부한 7량체로서, RNA 중합효소 II가 전사를 정확하게 개시할 수 있도록 위치를 잡는 역할을 함; 컨센서스=TATA(A 또는 T)A(A 또는 T)
terminator					전사체 말단 또는 프로모터 영역에 인접하여 위치하는 DNA 서열로서 RNA 중합효소가 전사를 종료하도록 함; 억제 단백질의 결합부위일 수 있음
transit_peptide					운송 펩티드 코딩 서열; 핵에서 코드되는 세포소기관 단백질의 N-말단 도메인의 코딩 서열; 이 도메인은 번역 후 단백질을 세포소기관으로 수송하는 과정에 관여함
tRNA					성숙 운반 RNA, 핵산 서열을 아미노산 서열로 번역하는 과정을 매개하는 작은 RNA 분자(75-84 염기 길이)
unsure					저자가 이 부위에서 정확한 서열을 알지 못함
V_region					면역글로불린 경쇄와 중쇄의 가변 영역 및 T-세포 수용체 알파쇄, 베타쇄, 그리고 감마쇄의 가변 영역; 가변 아미노 말단부에 대한 코드 ; V_segments, D_segments, N_regions, 및 J_segment로 구성될 수 있음
V_segment					면역글로불린 경쇄와 중쇄의 가변 단편 및 T-세포 수용체 알파쇄, 베타쇄, 및 감마쇄의 가변 단편 ; 가변 영역(V_region) 대부분과 리더 펩티드의 마지막 몇 개의 아미노산을 코드함
variation					관련 주(strain)가 주어진 위치(다른 위치도 포함할 수 있음)에서 현재의 서열과 다른, 동일 유전자의 안정한 돌연변이(예: RFLPs, 다형현상)를 가짐
3'clip					프로세싱 중 잘려지는 전구체 전사체(precursor transcript)의 가장 3'-쪽의 영역
3'UTR					단백질로 번역되지 않는 (종료 코돈 이후의)성숙 전사체의 3'말단 영역
5'clip					프로세싱 중 잘려지는 전구체 전사체의 가장 5'-쪽의 영역
5'UTR					단백질로 번역되지 않는 (개시 코돈 이전의) 성숙 전사체의 5'말단 영역
-10_signal					프리브노우 박스; RNA 중합효소의 결합에 관여하는 박테리아 전사 단위의 개시점보다 약 10bp 상류에 위치하는 보존된 영역; 컨센서스=TAtAaT
-35_signal					박테리아 전사 단위의 개시점보다 약 35bp 상류에 위치하는 보존된 6량체; 컨센서스-TTGACa[ ] 또는 TGTTGACA[ ]

「핵산염기 및 아미노산 기호 및 특징(Feature) 표」

6. 단백질 서열에 관련된 특징 기호 목록
기 호	설 명
CONFLICT	서로 다른 문헌에서 다른 서열을 보고한 경우
VARIANT	저자가 서열변이체가 존재한다고 보고한 경우
VARSPLIC	선택적인 스플라이싱에 의해 제조된 서열 변이체에 대한 설명
MUTAGEN	실험적으로 변화된 부위
MOD_RES	잔기의 번역 후 변형
ACETYLATION	N-말단 또는 기타 부위의 경우
AMIDATION	일반적으로 성숙 활성 펩티드의 C-말단에서의 경우
BLOCKED	N- 또는 C-말단 차단기를 알지 못하는 경우
FORMYLATION	N-말단 메티오닌의 경우
GAMMA-CARBOXY GLUTAMIC ACID HYDROXYLATION	아스파라긴, 아스파르트산, 프롤린 또는 리신의 경우
METHYLATION	일반적으로 리신 또는 아르기닌의 경우
PHOSPHORYLATION	세린, 트레오닌, 티로신, 아스파르트산 또는 히스티딘의 경우
PYRROLIDONE CARBOXYLIC ACID	내부 환상 락탐을 형성한 N-말단 글루타메이트의 경우
SULFATATION	일반적으로 티로신의 경우
LIPID	지질 잔기의 공유 결합
MYRISTATE	아미드 결합에 의해 성숙형 단백질의 N-말단 글리신 잔기 또는 내부 리신 잔기에 부착된 미리스테이트기
PALMITATE	티오에테르 결합에 의해 시스테인 잔기에 부착되거나 에스테르 결합에 의해 세린 또는 트레오닌 잔기에 부착된 팔미테이트기
FARNESYL	티오에테르 결합에 의해 시스테인 잔기에 부착된 파르네실기
GERANYL-GERANYL	티오에테르 결합에 의해 시스테인 잔기에 부착된 제라닐-제라닐기
GPI-ANCHOR	성숙형 단백질의 C-말단 잔기의 알파-카르복실기에 연결된 글리코실-포스파티딜이노시톨(GPI)기
N-ACYL DIGLYCERIDE	두 개의 지방산이 에스테르 결합에 의해 연결되어 있는, 아미드-결합된 지방산 및 글리세릴기를 갖는 원핵생물의 성숙형 지단백질의 N-말단 시스테인
DISULFID	디설파이드 결합; ‘FROM’ 및 ‘TO’ 끝점은 사슬 내의 디설파이드 결합에 의해 연결된 두 개의 잔기를 나타냄; ‘FROM’ 및 ‘TO’ 끝점이 동일한 경우, 디설파이드 결합은 사슬간 결합이고, 설명부분에 교차결합의 성질이 표시됨
THIOLEST	티오에스테르 결합; ‘FROM’ 및 ‘TO’ 끝점은 티오에스테르 결합에 의해 연결된 두 개의 잔기를 나타냄
THIOETH	티오에테르 결합; ‘FROM’ 및 ‘TO’ 끝점은 티오에테르 결합에 의해 연결된 두 개의 잔기를 나타냄
CARBOHYD	글리코실화 부위; 설명부분에 탄수화물의 특성(공지된 경우)이 표시됨
METAL	금속 이온의 결합 부위 ; 설명부분에 금속의 특성이 표시됨
BINDING	모든 화학적 기(조효소, 보흠기, 등)의 결합부위; 설명부분에 기의 화학적 특성이 표시됨
SIGNAL	시그널 서열을 나타냄(프리펩티드)
TRANSIT	(미토콘드리아, 엽록체, 또는 미립체의)전이 펩티드를 나타냄
PROPEP	프로펩티드를 나타냄
CHAIN	성숙 단백질의 폴리펩티드 사슬을 나타냄
PEPTIDE	방출된 활성 펩티드를 나타냄
DOMAIN	서열상의 목적 도메인을 나타냄; 설명부분에 도메인의 특성이 표시됨
CA_BIND	칼슘-결합 영역을 나타냄
DNA_BIND	DNA-결합 영역을 나타냄
NP_BIND	핵산염기 포스페이트 결합 영역을 나타냄; 설명부분에 핵산염기 포스페이트의 특성이 표시됨
TRANSMEM	막투과 영역을 나타냄
ZN_FING	징크-핑거(zinc finger) 영역을 나타냄
SIMILAR	다른 단백질 서열과의 유사성을 나타냄; 설명부분에 서열에 관한 상세한 정보가 표시됨
REPEAT	내부 서열 반복을 나타냄
HELIX	2차 구조:나선, 예를 들어, 알파-나선, 3(10)-나선 또는 Pi-나선
STRAND	2차 구조:베타-가닥, 예를 들어, 수소 결합된 베타-가닥, 또는 단리된 베타-브리지의 잔기
TURN	2차 구조 회전, 예를 들어, H-결합된 회전(3-회전, 4-회전 또는 5-회전)
ACT_SITE	효소의 활성에 관여하는 아미노산(들)
SITE	서열상의 다른 목적부위
INIT_MET	서열이 개시 메티오닌으로 시작한다는 것이 공지된 경우
NON_TER	서열의 제일 끝에 있는 잔기가 말단잔기가 아님 ; 위치 1에 적용할 경우, 이는 첫 번째 위치가 완전한 분자의 N-말단이 아님을 의미함; 마지막 위치에 적용될 경우, 이는 이 위치가 완전한 분자의 C-말단이 아님을 의미함 ; 이 기호에 대해서는 설명부분에 표시하지 않음
NON_CONS	비연속적인 잔기 ; 서열에서 두 개의 잔기가 연속적이지 않고, 이들 사이에 서열이 확인되지 않은 다수의 잔기가 있음을 의미함
UNSURE	서열의 불명확성 ; 저자가 서열 배열에 대해 확신하지 못하는 서열의 영역을 기술하는데 사용됨